Během posledních dnů republiky se Hvězdné války vesmíru byla zasažena masivní rána na světlou stranu Síly. Jedním rychlým příkazem císař Palpatine aktivoval rozkaz 66. Protokol byl implantován pomocí čipu do každého vojáka v klonové armádě a po aktivaci přinutil vojáky popravit všechny Jedi v jejich okolí. Velká čistka Jedi dala do klidu obrovské množství Jediů a jejich smrtí ukončila všechny mise a záhady, které ještě nebyly dokončeny.
Ze všech Jediů, kteří padli v ten osudný den, se žádný nezdál tak brutální jako smrt Aayly Secury na živé planetě Felucia. Star Wars Episode III: Revenge of the Sith ukazuje mladou Twi'lek zastřelenou jejím klonovým praporem. Je smutné, že když padla, vyrušil ji pták a nedokázala reagovat. Výstřel však přetrvává ještě několik sekund a ukazuje, jak klony pokračují v palbě na její inertní tělo. Z jejího strašlivého zániku vyvstalo mnoho otázek, když se fanoušci snažili přijít na to, proč klony vypadaly vůči ní tak chladnokrevně.
Stejně jako její pán Quinlan Vos se i Secura rozhodla kráčet svou vlastní cestou a přitom dbát řádu Jediů. To se ukázalo na jejím výběru oblečení a na způsobu, jakým třímala světelný meč reverzním stiskem. Secura se hluboce starala o svého pána, který byl ve Síle jedinečně silný. Mnoho teoretiků věří, že ve Síle byla také nesmírně silná. Pokud by tomu tak bylo, důvodem, proč ji klony střílely dolů, mohlo být to, že se nedostala nahoru, aby svými schopnostmi způsobila obrovské škody.
Většina Securových dobrodružství jí neukazuje, že by během Klonových válek ve Síle používala jakoukoli nesmírnou sílu. Přesto je zcela možné, že se její schopnosti dosud plně neprojevily. Alternativně mohla být její síla směrována prostřednictvím její bojové schopnosti, která využívala boj světelných mečů Formy IV a Formy V a zahrnovala spoustu akrobacie a útočných pohybů velkou rychlostí.
Další teorie, která byla představena, byla silně svázána s Securovým vztahem s jejím klonovým praporem. Vzhledem k mnoha letům, které Jedi strávili se svými klonovými vojáky, se mezi oběma skupinami vytvořilo mnoho pout. Mezi nejlepší příklady patří kapitán Rex a Ahsoka Tano nebo velitel Cody a Obi-Wan Kenobi. S touto logikou mohli klony nepřetržitě střílet na Securu, protože si pamatovali historii, kterou s ní sdíleli, a chtěli zajistit, aby její smrt byla rychlá a bezbolestná. Pokud by to byla pravda, bylo by to jejich finální jednání jako klonoví vojáci jedním z nejmilosrdnějších očištění.
Aayla Secura byla jednou z nejvíce soucitných Jediů v řádu. Z tohoto důvodu byl její násilný konec považován za jeden z nejbrutálnějších ve Velké čistce Jediů. Securova smrt také představuje rychlou a chirurgickou devastaci, kterou se císař rozhodl dosáhnout. Zabít Jediho zabere hodně, dokonce i Anakina Skywalkera Skrytá hrozba nevěřil, že je možné je všechny porazit. Císař mu však dokázal, že se mýlil, když téměř každý z nich jednou ranou vyhladil.
Smrt téměř každého Jediho přišla rychle a násilně. Během události byly mezi posledními pocity, které přeživší uživatelé Síly cítili, zrada a bolest. Dokonce i Securova smrt zasáhla Yodu, který byl v té době na úplně jiné planetě. Přesný důvod, proč klony tolikrát střílely na Securu, zůstává záhadou. Toto tajemství nicméně umožnilo fanouškům spojit se, aby znovu spekulovali o mnoha dalších záhadách ve vesmíru hvězdných válek.
