The Assassin's Creed franšíza vždy vyprávěla svůj příběh z pohledu Assassin Order. S templářským řádem prosazujícím mír odstraněním svobodné vůle bylo vždy jasné, kdo má pravdu. Existuje však jeden titul předvedl perspektivu řádu templářů - a jak jeden přeběhlík téměř zničil Colonial Brotherhood of Assassins.
Assassin's Creed Rogue představil mladého vraha jménem Shay Patrick Cormac, který byl členem Amerického bratrstva těsně před sedmiletou válkou. On a jeho přítel Liam O'Brien dostali za úkol lovit artefakty, o nichž Řád věřil, že jsou vázány na Kusy ráje. Ty existovaly dlouho před zrozením vyznání víry a měly tak velkou moc, že pokud by templáři získali kontrolu i nad jedním z nich, mohli by zotročit celé lidstvo.
Dvojici se podařilo najít jeden artefakt ve starobylém chrámu pod Lisabonem. Shay to však vyvolalo zemětřesení, které zabilo a uvázlo tisíce lidí. Tato zkušenost ho vedla k přesvědčení, že vrahové se o nevinné nestarají, nyní je považoval za opak hrdinů, o kterých si myslel, že jsou. Shay se otočil zády k Řádu a vystavil svůj život riziku, když ho spolupracovníci pronásledovali. Nakonec si našel cestu k koloniálnímu obřadu templářského řádu a odtud se postavil na stranu Assassinova zapřísáhlého nepřítele a slíbil, že svým starým spolupracovníkům nedovolí najít jiný chrám.
Během sedmileté války Shay pronásledoval své staré vrahové partnery s templářským velmistrem Haythamem Kenwayem. Haytham byl synem pirátského vraha Edwarda Kenwaye, ale byl vychován, aby následoval templáře. V průběhu let si Haytham a Shay získali silnou pozici v koloniích a vyhráli sedmiletou válku pro templáře. Také vyloučil některé z nejmocnějších členů Koloniálního bratrstva.
Vyvrcholení Assassin's Creed Rogue viděl, jak Shay zabíjí svého starého přítele Liama a Haythama a ochromuje jejich vůdce Achilla Davenporta. Sedm let byli Vrahové neorganizovaní a bez vedení, protože Shay a templáři ovládali kolonie ze stínu. Nebylo by to dalších sedm let, než dorazí Haythamův syn Connor a bude pokračovat tam, kde Achilles přestal, eliminováním templářské hrozby v Americe a napomáháním vítězství země proti britské koruně během jednoho z nejdůležitějších konfliktů historie, americké revoluce.
Cormac pokračoval v práci s templářským řádem a lovil starodávné artefakty, které by jim pomohly získat náskok před Assassiny. Když Connor pokračoval v osvobozování kolonií, Shay byl v Paříži a měl za úkol zabít vraha, který držel posvátnou schránku, která mohla odemknout starodávná tajemství a existovala již jako čínský vrah Shao Jun. Vrah, kterého zabil, byl otcem Arna Doriana, zabijáka, který by pomohl osvobodit Paříž Assassin's Creed Unity . Přestože Shay Cormac úplně nezničil Americké bratrstvo vrahů, ukázal, jak rychle se mohou rozbít, když jeden z nich změní strany.
